武漢大學馬克思主義教學科研單位最早可以追溯到20世紀50年代初，當時就設有馬列主義教研室。1953年，李達從湖南調入武漢大學任校長后，兼任馬列主義教研室主任。
1960年，學校設立政治系，宗旨是培養馬列主義宣傳教育的專門人才，開設有關黨史、共運史以及馬列主義基礎理論方面的課程，招收國際共運史和中共黨史兩個專業的學生。
1971年，學校成立政治理論教研室，擔負全校馬列主義公共課教學，下設哲學、政治經濟學、國際共運史和中共黨史等四個教研室。
其間，1975年學校在襄樊設立政治系，開課和辦學宗旨與1960年同。
1980年初，學校恢復建立政治理論教研室，后改為馬列主義基礎部，下設中共黨史、政治經濟學、科學社會主義和哲學等四個教研室和一個資料室，擔負全校政治理論課教學。
1984年，建立政治學系，在擔負全校政治理論課教學的同時，設立思想政治教育專業，招收全國首批思想政治教育專業本科生。
1986年，政治學系分成政治教育系和政治系，前者由擔負全校公共理論課的教師和原思想政治教育專業的教師組建而成，后者并入法學院。
1993年1月，學校正式成立政治與行政學院，設立政治學系、政治理論系和思想政治教育系。
1999年6月，政治與行政學院整體并入法學院，組建新的法學院，思想品德課程從學校德育研究室轉入政治與行政學院，后一起并入法學院。
2001年1月，學校重建政治與行政學院，設政治與行政系、政治理論系、思想政治教育系和思想品德課部。
2003年8月，學校組建立政治與公共管理學院，設政治學與國際關系學系、思想政治教育系、政治理論系和公共管理系。
2011年7月，學校建立馬克思主義學院，設馬克思主義基本理論系、馬克思主義中國化系和思想政治教育系。
歷任院（系）主要負責人
1953---1957，馬列主義教研室，主任：李達（兼）
1958---1959，馬列主義教研室，主任：劉仰橋（兼）
1960---1963，政治系，主任：何定華 書記：張煥潮
1971---1977，政治理論教研室，主任：劉德厚 書記：劉德厚
1980--1983，政治理論教研室（后改名為馬列主義基礎部），主任：劉德厚 書記：張孝宜
1984--1985，政治學系，主任：劉德厚 書記：張孝宜
1986--1992，政治教育系，主任：劉行炎 書記：王長銘
1993--1996，政治與行政學院，院長：劉德厚 書記：駱郁廷
1996--1999，政治與行政學院，院長：羅志剛 書記：孫居濤
1999—2000，法學院，院長：曾令良 書記：孫居濤
2001—2003，政治與行政學院，院長：譚君久 書記：駱郁廷（2001-2002）丁俊萍（2002-2003）
2003—2007，政治與公共管理學院，院長：丁俊萍 書記：彭宇文
2007—2011，政治與公共管理學院，院長：佘雙好 書記：杜曉成（2007-2009）譚玉敏（2010-2011）
2011----，馬克思主義學院，院長：佘雙好 書記：譚玉敏
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